{"id":10636,"date":"2022-02-01T07:36:35","date_gmt":"2022-02-01T06:36:35","guid":{"rendered":"https:\/\/thesmartcityjournal.cibeles.net\/sin-categorizar\/descubren-mas-de-cien-mil-virus-desconocidos-mediante-una-nueva-herramienta-informatica\/"},"modified":"2022-01-31T18:37:19","modified_gmt":"2022-01-31T17:37:19","slug":"descubren-mas-de-cien-mil-virus-desconocidos-mediante-una-nueva-herramienta-informatica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.thesmartcityjournal.com\/es\/smart-health\/descubren-mas-de-cien-mil-virus-desconocidos-mediante-una-nueva-herramienta-informatica","title":{"rendered":"Descubren m\u00e1s de cien mil virus desconocidos mediante una nueva herramienta inform\u00e1tica"},"content":{"rendered":"<p class=\"lead\">Investigadores del CSIC participan en un equipo internacional que utiliza un programa de computaci\u00f3n en la nube para analizar millones de experimentos y muestras biol\u00f3gicas de todo el planeta.<\/p>\n<p>Los virus son el conjunto de agentes biol\u00f3gicos m\u00e1s numeroso que se conoce. Ahora, un equipo internacional de cient\u00edficos donde participa el <strong>CSIC<\/strong> ha dado un importante paso para conocer su diversidad. Este equipo ha descubierto m\u00e1s de 130.000 nuevos virus de ARN (como es el coronavirus SARS-CoV-2 que provoca la actual pandemia de covid-19) a trav\u00e9s de una nueva herramienta inform\u00e1tica con la que se analizaron 5,7 millones de muestras biol\u00f3gicas recogidas a lo largo del planeta durante los \u00faltimos 15 a\u00f1os. Este hallazgo, que se publica en la revista&nbsp;<em><a href=\"https:\/\/doi.org\/10.1038\/s41586-021-04332-2\" target=\"_parent\">Nature<\/a><\/em>, supone un incremento de hasta 10 veces el n\u00famero de especies virales de ARN descritas hasta la fecha.<\/p>\n<p>Para este an\u00e1lisis, el equipo multidisciplinar desarroll\u00f3&nbsp;<em>Serratus<\/em>, una infraestructura de computaci\u00f3n en la nube <strong>Amazon Web Services, AWS,<\/strong>&nbsp;que, usando un cl\u00faster de 22.500 procesadores inform\u00e1ticos (CPUs), permiti\u00f3 b\u00fasquedas masivas de secuencias virales en los millones de Gigabytes (Petabytes) de datos de secuenciaci\u00f3n disponibles en bases de datos p\u00fablicas.<\/p>\n<p>El an\u00e1lisis detallado de ciertas familias virales permiti\u00f3 el descubrimiento de m\u00e1s de 30 nuevas especies de coronavirus, incluyendo interesantes ejemplos en vertebrados acu\u00e1ticos como peces y anfibios cuyos coronavirus presentaron un genoma segmentado en dos fragmentos, una caracter\u00edstica descrita en otras familias de virus pero no detectada antes en ning\u00fan miembro de los coronavirus.<\/p>\n<p>En el <strong>Instituto de Biolog\u00eda Molecular y Celular de Plantas de Val\u00e8ncia (IBMCP)<\/strong> utilizaron&nbsp;<em>Serratus<\/em>&nbsp;para el an\u00e1lisis del virus causante de la hepatitis D humana, un agente viral llamado Delta, de tama\u00f1o gen\u00f3mico m\u00ednimo y origen desconocido. Esto permiti\u00f3 al investigador del CSIC en&nbsp;IBMCP,&nbsp;Marcos de la Pe\u00f1a Rivero, detectar virus similares en multitud de otros animales, incluyendo no s\u00f3lo mam\u00edferos y otros vertebrados, sino tambi\u00e9n invertebrados. \u201cSorprendentemente, estos virus se encontraron tambi\u00e9n en muestras medioambientales recogidas en lagos y suelos de todo el mundo, y cuyos hu\u00e9spedes ser\u00edan por el momento desconocidos\u201d, revela de la Pe\u00f1a.<\/p>\n<h2 class=\"article-title\">Conexi\u00f3n evolutiva entre virus de humanos y plantas en el medio ambiente<\/h2>\n<p>M\u00e1s a\u00fan, las muestras medioambientales con virus similares al de la hepatitis D revelaron la presencia de novedosas formas virales con genomas ultra-compactos y de tama\u00f1o \u00ednfimo (s\u00f3lo 300 bases, las unidades qu\u00edmicas que forman el material gen\u00e9tico). \u201cEste descubrimiento permite avanzar una conexi\u00f3n evolutiva cercana entre virus tan distantes como la hepatitis D humana y los agentes subvirales de plantas llamados \u2018viroides\u2019\u201d, apunta el investigador del CSIC.<\/p>\n<p>Tanto la base de datos de todos los virus obtenidos en este trabajo como el conjunto de las herramientas desarrolladas, est\u00e1n disponibles de forma libre y abierta (<a href=\"http:\/\/www.serratus.io\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">www.serratus.io<\/a>). Esta herramienta puede ser de gran utilidad para caracterizar la diversidad planetaria de todos los virus existentes y prepararse ante posibles nuevas pandemias, cuyas devastadoras consecuencias sufrimos con enfermedades virales emergentes como la covid-19, causada por el coronavirus SARS-CoV-2.<\/p>\n<p>El <strong>IBMCP<\/strong>, <strong>centro mixto del CSIC<\/strong> y la <strong>Universitat Polit\u00e8cnica de Val\u00e8ncia<\/strong>, es la \u00fanica instituci\u00f3n cient\u00edfica espa\u00f1ola que participa en este trabajo, donde colaboran, entre otros, el <strong>Instituto Heidelberg de Estudios Te\u00f3ricos<\/strong> y el <strong>Instituto Max Planck de Bilog\u00eda (Alemania)<\/strong>;<strong> el Instituto Pasteur (Francia); la Universidad de San Petersburgo (Rusia); la Universidad de California, Berkeley (EE.UU.); y la Universidad de British Columbia (Canad\u00e1).<\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Investigadores del CSIC participan en un equipo internacional que utiliza un programa de computaci\u00f3n en la nube para analizar millones de experimentos y muestras biol\u00f3gicas de todo el planeta. 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Ahora, un equipo internacional de cient\u00edficos donde participa el CSIC ha dado un importante paso para conocer su diversidad. Este equipo ha descubierto m\u00e1s de 130.000 nuevos virus de ARN (como es el coronavirus SARS-CoV-2 que provoca la actual pandemia de covid-19) a trav\u00e9s de una nueva herramienta inform\u00e1tica con la que se analizaron 5,7 millones de muestras biol\u00f3gicas recogidas a lo largo del planeta durante los \u00faltimos 15 a\u00f1os. 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